Guía docente de Virología y Micología Clínicas (20411B9)

Se recomienda tener cursadas las asignaturas Microbiología I y Microbiología II, con el objeto de poseer conocimientos adecuados sobre:

• Virología y micología (a nivel de microbiología general)
• Inmunología (conocimientos básicos de: inmunidad innata y específica, reacción antígeno-anticuerpo, inmunopatología)

• Virología clínica: Interacciones hospedador-patógeno en las infecciones virales. Virus patógenos de humanos. Prevención y tratamiento de infecciones virales humanas. Procesamiento de muestras para determinación de virus patógenos: cultivo e identificación de virus, detección de antígenos virales, detección de ácidos nucleicos virales.
• Micología clínica: Patogénesis de las micosis humanas. Principales hongos patógenos de humanos. Procesamiento de muestras en micología clínica. Técnicas de identificación de hongos patógenos. Agentes antifúngicos.

1. Demostrar la comprensión detallada de la patogénesis y sintomatología de las infecciones humanas por virus y hongos, en correlación con los métodos de diagnóstico de laboratorio.
2. Manejar los protocolos de toma y procesamiento de muestras para el diagnóstico de laboratorio de virosis y micosis humanas.
3. Interpretar los datos de diagnóstico de laboratorio de virosis y micosis y elaboración de los correspondientes informes.
4. Reconocer el potencial de aplicación de nuevas tecnologías en el diagnóstico de laboratorio de virosis y micosis humanas.

EXTENSIÓN: 4,5 créditos

1. Introducción a la Virología Clínica. 1 hora
2. Virus patógenos del ser humano: situación taxonómica y características. 10 horas
3. La infección viral en células de mamífero. 3 horas
4. Inmunidad y patogénesis en las infecciones virales. 6 horas
5. Prevención y terapia de las infecciones virales. 4 horas
6. Cultivo e identificación de virus patógenos. 2 horas
7. Detección de antígenos y de ácidos nucleicos virales. 2 horas
8. Serodiagnóstico de las infecciones virales. 1 hora
9. Diagnóstico de laboratorio de síndromes infecciosos causados por virus. 1 hora
10. Introducción a la Micología Clínica. 1 hora
11. Micosis superficiales, cutáneas y subcutáneas. 3 horas
12. Micosis profundas y sistémicas. 3 horas
13. Diagnóstico micológico: recogida, transporte y procesamiento de muestras. 1 hora
14. Cultivo e identificación de hongos patógenos. 2 horas
15. Diagnóstico serológico y molecular de las micosis. 2 horas
16. Antifúngicos y pruebas de sensibilidad. 2 horas

EXTENSIÓN: 1,5 créditos

1. Cultivo de una línea celular en monocapa.
2. Cultivo de herpesvirus en “Shell vial”.
3. Detección de antígenos virales en heces.
4. Cultivo y observación de levaduras.
5. Detección de anticuerpos heterófilos para diagnóstico de mononucleosis infecciosa por el virus de Epstein-Barr.

• Bonifaz, A. 2020. Micología Médica Básica, 6ª edición. McGraw-Hill, Madrid.
• Flint J, Racaniello VR, Rall GF, Skalka AM. Principles of Virology, Fourth Edition. 2015. ASM Press, Washington
• Norkin, L.C. 2010. Virology : Molecular Biology and Pathogenesis. ASM Press, Washington.
• Shors, T. 2009. Virus. Estudio molecular con orientación clínica. Editorial Médica Panamericana.
• Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW, Eds. Manual of Clinical Microbiology, Eleventh Edition. 2015. ASM Press, Washington.
• Specter , S., Hodinka , R.L., Young, S.A. y Wiedbrauk. D.L. 2009. Clinical Virology Manual (4ª ed.). ASM Press, Washington.
• Pemán, J., Martín-Mazuelos, E. y Rubio Calvo, M.C. 2007. Guía Práctica de Identificación y Diagnóstico en Micología Clínica, 2ª edición. Revista Iberoamericana de Micobiología. 20 capítulos de acceso libre en: http://www.guia.reviberoammicol.com/

• Aguilera, A., Alonso, R., Córdoba, J., Fuertes, A.. 2014. Diagnóstico microbiológico de las hepatitis víricas. 50. Alonso R (coordinador). Procedimientos en Microbiología Clínica. Cercenado E, Cantón R (editores). Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clínica (SEIMC), Madrid.
• Aguilera A, Álvarez M, García F, Reina G, Rodríguez C. 2014. Diagnóstico microbiológico de la infección por el VIH. 6a. García F. (coordinador). Procedimientos en Microbiología Clinica. Cercenado E, Cantón R (editores). Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clínica (SEIMC), Madrid.
• Boyer, Z., Palmer, S. 2018. Targeting immune checkpoint molecules to eliminate latent HIV. Front. Immunol. 9:2339. doi: 10.3389/fimmu.2018.02339.
• Calderone , R.A. y Clancy, C.J. 2012. Candida and Candidiasis (5ª edición). ASM Press, Washington.
• Campitelli, M., Zeineddine, N., Samaha, G., Maslak, S. 2017. Combination Antifungal Therapy: A Review of Current Data. J Clin Med Res. 9:451-456.
• Cantón, E., García, J., Guinea, J.V., Martin, E., Peman, J. 2012. Métodos microbiológicos para el diagnóstico, manejo y estudio de la infección fúngica invasora. 45. Procedimientos en Microbiología Clínica. Cercenado E, Cantón R (editores). Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clínica (SEIMC), Madrid.
• Corti, D., Lanzavecchia, A. 2013. Broadly neutralizing antiviral antibodies. Annu Rev Immunol. 31:705–742.
• Fortun, J. 2011. Actualización en terapia antifúngica: nuevos fármacos e indicaciones. Enferm Infecc Microbiol Clin. 29(Supl 5):38-44.
• GESIDA 2019. Documento de consenso de Gesida/Plan Nacional sobre el Sida respecto al tratamiento antirretroviral en adultos infectados por el virus de la inmunodeficiencia humana. Ministerio de Sanidad, Consumo y Bienestar Social.
• Heldt, S., Hoenigl, M.2017. Lateral Flow Assays for the Diagnosis of Invasive Aspergillosis: Current Status. Curr Fungal Infect Rep. 11:45-51.
• Larone, D.H. 2011. Medically Important Fungi: A Guide to Identification (5ª edición) ASM Press, Washington.
• Lou, Z., Sun, Y., Rao, Z. 2014. Current progress in antiviral strategies. Trends Pharmacol Sci. 35:86-102.
• Ruiz-Bravo, A., Jimenez-Valera, M. 2020. SARS-CoV-2 y pandemia de síndrome respiratorio agudo (COVID-19). Ars Pharm. 61(2): 63-79. http://dx.doi.org/10.30827/ars.v61i2.15177
• Ubol, S., Halstead, S.B. 2010. How Innate Immune Mechanisms Contribute to Antibody-Enhanced Viral Infections . Clin Vacc Immunol.17:1829–1835.
• VHO. 2016. Consolidate guidelines on the use of antiretroviral drugs for treating and preventing HIV infection. World Health Organization, Geneva.
• Vogel, O.A., Manicassamy, B. 2020. Broadly protective strategies against influenza viruses: Universal vaccines and therapeutics. Front. Microbiol. 11:135. doi: 10.3389/fmicb.2020.00135

• Sociedad Española de Microbiología (SEM): http://www.semicrobiologia.org/ Aparte de su interés general para los microbiólogos, existe un Grupo Especializado en “Biología de los Microorganismos Patógenos” https://www.semicrobiologia.org/grupos-especializados/biologia-de-los-microorganismos-patogenos
• Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC): http://www.seimc.org/index.php Especial interés tiene el apartado de “Documentos Científicos”, concretamente la serie “Procedimientos en Microbiología Clínica”, varios de los cuales se dedican al diagnóstico microbiológico de infecciones por virus y hongos.
• American Society for Microbiology (ASM): http://www.asm.org/. Esta extensa sociedad científica ofrece información muy diversa, actualizada y de total garantía sobre todas las áreas de especialización de la Microbiología, incluyendo Virología y Micología Clínicas. Edita un gran número de revistas especializadas con altos índices de impacto y libros de gran calidad. Los socios de la ASM pueden integrarse en Grupos especializados, según sus intereses científicos.
• International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV): https://talk.ictvonline.org/. Es la fuente oficial de taxonomía de virus, actualmente en período de construcción de los taxones superiores. Incluye la última version de clasificación (ICTV Taxonomy Release), y todas las versions anteriores; y el “ICTV report on virus classification and taxon nomenclature”, que incluye descripciones de los taxones (actualmente aún incompleta).
• ViralZone: https://viralzone.expasy.org/. Sitio web mantenido por la “SIB Swiss Institute of Bioinformatic”; incluye descripciones y diagramas de los virus, y actualizaciones sobre biología molecular viral, agentes antivirales y atención especial a HIV, hepatitis B, herpesvirus y coronavirus.

• MD01. Lección magistral/expositiva 
• MD04. Prácticas de laboratorio y/o clínicas y/o oficinas de Farmacia 
• MD07. Seminarios 
• MD10. Realización de trabajos individuales 
• MD12. Tutorías 
• MD13. Participación en plataformas docentes 

Las pruebas de evaluación están dirigidas a valorar si se han adquirido las competencias descritas; para ello se seguirá un proceso de evaluación continua de los siguientes parámetros:

• Asistencia a clases teóricas y prácticas.
• Participación en seminarios y otras actividades, según las posibilidades de realización.
• Evaluación del aprendizaje de las clases prácticas.
• Evaluación de los contenidos teóricos de las clases magistrales mediante pruebas escritas.

Criterios de evaluación:

• Evaluación de los contenidos teóricos mediante pruebas escritas:
• - Evaluación de los contenidos teóricos de Virología 60%
• - Evaluación de los contenidos teóricos de Micología 20%
• Evaluación de clases prácticas: 10%
• Evaluación de seminarios, asistencias a clases y otras opciones de participación activa del alumno: 10%

Para superar la asignatura es imprescindible:

• Tener aprobadas las clases prácticas (mitad de la valoración asignada)
• Tener aprobada la parte de contenidos teóricos (mitad de la valoración asignada).

Se realizará un examen parcial, que comprenderá la parte de la asignatura que se haya explicado con suficiente antelación a la fecha dispuesta por la Facultad, y un final que incluirá el resto de la asignatura. Los estudiantes que no hayan superado el parcial realizarán los exámenes de ambas partes en las convocatorias ordinaria o extraordinaria.

• Examen final teórico: 90 % (Contenidos de Virología, 65 % y de Micología, 25 %)
• Examen práctico (en caso de no haber superado las prácticas en la convocatoria ordinaria): 10 %

Para acogerse a la “Evaluación única final”, el estudiante deberá seguir el procedimiento recogido en el artículo 8.2 de la “Normativa de evaluación y calificación de los estudiantes de la UGR” .

Se recuerda que, de acuerdo con dicha normativa, “para acogerse a la evaluación única final, el estudiante, en las dos primeras semanas a partir de la fecha de matriculación del estudiante, lo solicitará al Director del Departamento, quien dará traslado al profesorado correspondiente, alegando y acreditando las razones que le asisten para no poder seguir el sistema de evaluación continua”.

La evaluación única final constará de un examen escrito de los contenidos del programa teórico de la asignatura, y un examen de los contenidos del programa de prácticas, que podrá incluir preguntas de desarrollo o de opción múltiple, problemas numéricos, así como la realización experimental de alguna práctica de laboratorio.

Para aprobar la asignatura es imprescindible aprobar el examen de contenidos teóricos obteniendo como mínimo una puntuación de 5 sobre 10. Así mismo es imprescindible aprobar el examen de prácticas obteniendo como mínimo una puntuación de 5 sobre 10. La nota final de la asignatura se obtendrá de la nota de teoría, que supondrá hasta el 90% de la nota final, y de la nota de prácticas que supondrá hasta el 10% de la nota final.

Los exámenes se realizarán los días y a las horas que la organización de la Facultad asigne a la asignatura.